1、中华鲟：（保护级别一级）
2、长江鲟：（保护级别一级）
3、白鲟、（保护级别一级）
4、花鳗鲡：（保护级别二级）
5、鲥：（保护级别一级）
6、胭脂鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
7、稀有鮈（jū)鲫：（保护级别二级、仅限野外种群）
8、鯮 （zōng）：（保护级别二级）
9、圆口铜鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
10、长鳍吻鮈（jū)：（保护级别二级）
11、四川白甲鱼：（保护级别二级）
12、多磷白甲鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
13、金沙鲈鲤：（保护级别二级、仅限野外种群）
14、细鳞裂腹鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
15、重口裂腹鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
16、厚唇裸重唇鱼：（保护级别二级、仅限野外种群）
17、岩原鲤：（保护级别二级、仅限野外种群）
18、红唇薄鳅：（保护级别二级、仅限野外种群）
19、长薄鳅：（保护等级二级、仅限野外种群）
20、青石爬鮡：（保护等级二级）
21、川陕哲罗鲑：（保护等级一级）
22、松江鲈鱼：（保护等级二级、仅限野外种群）
长江流域的保护鱼类22种，但有些鱼类并非只在长江分布，其他地区也有分布，并且其他地方的保护鱼类，在长江中也有生存，这里只是做一个参考。
