一共有16个：昆明站、瑞丽站、河口站、畹町站、磨憨站、天保站、金水河站、景洪港站、西双版纳站、腾冲站、打洛站、清水河站、马关站、勐康站、丽江站、芒市机场站
云南出入境边防检查总站，前身为云南省公安边防总队（武警云南省边防总队），2019年1月1日，按照《深化党和国家机构改革方案》，云南省公安边防总队官兵全部退出现役，转入人民警察体制。
云南省怒江州有4个边防检查站
3个在泸水县，1个在福贡县。
详见：
蛮云边境检查站(泸水县)
花桥坝边境检查站(泸水县)
片马边境检查站(泸水县片马镇)
鹿马登边检查站(福贡县鹿马登乡)
