1.存储介质不同。u盘又被称之为USB闪存盘，其存储芯片主要是由半导体材料制成的，和固态硬盘类似，而移动硬盘一般多采用磁盘作为存储介质，和机械硬盘相同，是有磁性介质作为存储的。
2.存储容量不同。u盘常见的容量有8G、16G、32G还有128G，而移动硬盘的存储容易起码是500GB起步，这样一对比，u盘的容量相对而言还是比较小的。
存储原理不同
移动硬盘是由磁片作为存储介质的，和磁带一个原理，只不过方式不同，结构不同。U盘则不一样，它是由半导体芯片作为存储介质的，内部由逻辑记忆电路组成的。
体积和重量不同
移动硬盘体积都比较大，目前1.8英寸和2.5英寸的产品是主流，重量一般都在500g以上。U盘体积就比较小，重量呢也很轻，方便随身携带。
读写速度不同
我们用普通U盘和机械移动硬盘做比较，如果是同一传输接口，那么就是移动硬盘比较快，现在市场上的移动硬盘一般采用USB 3.0接口，最高能达到的传输速度在100MB左右。而普通U盘读写速度一般，即使是3.0的接口，大部分也是几十MB/S，这个原因主要是因为普通U盘所采用的主控芯片，大都多是廉价方案。
故障率不同
U盘抗震能力比较好，不怕摔坏，一般外力很少能损坏U盘得。还有，U盘在从电脑拔掉前，建议使用安全卸载来进行移除，不去强行拔出它，一般是不会出故障的。但移动硬盘不太一样，因为内部有机械结构，所以抗震能力很差，撞击或跌落，都很有可能导致内部的磁头损坏，容易造成数据丢失或者损坏，所以移动硬盘和U盘比起来，更容易出故障。
容量差不同
常用的移动硬盘容量一般是500G的居多，最大可达12TB的容量，而U盘的常用容量在8G-128G之间，最大可达1T的容量，两者相比来说，U盘是比较小的。
价格不同
U盘是闪存芯片，造价更高，移动硬盘是磁道记忆，容量大，但造价相对较低。所以在相同的容量下，U盘要比移动硬盘贵许多。
