唐开元末年，泉州孔庙名为鲁司寇庙，址在府衙城右。
五代，改为宣圣庙，址同上。
宋太平兴国初（976-984）迁建泉州崇阳门外之东南，即今址。
大中祥符二年（1009）迁建于育材坊，去旧学西北。
大观三年（1109）复迁建于原址崇阳门外。
绍兴七年（1137）就原址重建左学右庙，增旧基高二尺余，中为先师殿（大成殿），殿前东西庑。殿左为明伦堂，明伦堂后为议道堂，前为东西十二齐。殿堂南面筑有方池、学池。前为藏书阁、廨宇、庖廪悉备。又化赎庚门旧址门西向，门内凿河浚池以通巽流，筑石桥以纳潮汐。
嘉泰元年（1201）再建棂星门，辟武齐。
嘉泰四年（1204）增置官书三千五百余本。
咸淳（1265--1274）中，殿毁，又重建。
元大德三年（1299）。重修明伦堂。
大德十年（1306）整治学校，修大晟乐。
至治元年（1321）塑两庑从祀像，筑杏坛于棂星门前。
至正初（1341—1349）造大晟，铸礼器。 九年（1493）大风发屋，稍作修葺。
嘉靖三年（1524）扩广泮池，浚堙塞以通潮汐，易濠南居民，辟路通通淮大街。
万历三十七年（1609）地震，殿堂两庑圮又重修。
万历四十年（1612）改泮池为园如右官之制。
清乾隆二十六年（1761）大修大成门，内外及两庑前柱皆易以石，作金声、玉振二门石匾，移建崇圣祠于礼殿东北。
康熙二十七年，雍正五年，乾隆三年共颁发“万世师表”、“生民未有”、“与天地参”三匾，后又有嘉庆帝“圣集大成”，道光帝“圣协时中”，咸丰“德齐帱载”，同治“圣神天纵”，光绪“斯文在兹”等。
