当初皇太极鲸吞正蓝旗，将其混入两黄旗，而以豪格、阿巴泰之原镶黄旗部分旗人及正蓝旗部分旗人组成新正蓝旗，以豪格为正蓝旗主。
十几年后，依样画葫芦，多尔衮又兼并豪格之正蓝旗，将其属人调入两白旗，以原正蓝旗人为主体与部分白旗人员组成新镶白旗，自己兼领镶白旗。但最终结果还是皇太极本支的帝系取得胜利。此后，由于没收多尔衮所领之旗，顺治帝自领镶黄、正黄、正白三旗，顺治帝之侄富绶入镶白，此旗又只有这一支封王，另外，顺治之兄硕塞及其子庄亲王博果铎封植镶红，地位在原镶红旗主岳托之孙平郡王罗科铎之上，是太宗皇太极之子孙已统领或控制了五个旗，镶蓝旗济尔哈朗及其诸子又靠拢帝室，帝系势力大大超过以前。八旗中的另外两旗，正红旗代善之子孙已保持中立，正蓝旗中，阿巴泰之子岳乐晋封安亲王，多尼降郡王，政治地位进一步受到压抑，帝系之领旗及势力在八旗中居重驭轻，已占绝对优势。皇帝与旗主王公之间及旗主王公之间，因各自领旗势力而导致的对清初政局产生重大影响的矛盾斗争，从此也不再出现。
