水门百战和普通水门在以下三个方面存在区别：
攻击速度：百战水门拥有非常高的普攻频率，出手速度比火影忍者中的鹰小队还要快很多。而普通水门在普通状态下技能施放间隔较长，对于手速快的玩家可以用来打输出或消耗型使用。
特殊技能效果：百战水门开启仙人模式后不但能对前方敌人进行仙法螺旋弹跳还带击飞效果，身后留下一道水源，仿佛将敌方拉过来一般，并对命中目标造成高额的伤害以及部分晕眩、吸附效果。而普通水门在原著中没有展示过类似的效果。
获取方式：百战水门是游戏里高级招募高招S级别忍者的体验卡，而普通水门在之前的一些任务中出现过他的回忆镜头。以后应该还会上线其他的渠道供玩家获得这个人物角色，所以两者的获得难度及时间都不大相同。
综上所述，百战水门和普通水门在攻击速度、特殊技能效果和获取方式上存在区别。
