我更偏向于FBI不知道柯南和小哀真实身份，最起码剧情至今没有明确表示他们知道。
茱蒂在TV 345中问贝尔摩德“柯南那个孩子的确很聪明，但他只是个孩子不是吗？”贝尔摩德未回答，之后茱蒂也一直称呼柯南为“Cool boy”而不是贝尔摩德所称呼的“Cool Guy”。可以看出茱蒂知道柯南很聪明，但是尚未明确怀疑他的真实身份。
赤井秀一很信任柯南并与之通力合作，因此可能调查过柯南身份。如果认为冲矢昴就是秀一，则已经明确得知，但目前尚未证明这一点 。
至于小哀，TV 335中赤井秀一曾看着小哀照片说“（和宫野志保相比）真是像啊”，TV 345中也说“我还不能和这个茶色头发的女孩见面”，说明赤井很可能知道灰原真实身份。
其他FBI成员，如茱蒂·斯泰琳和詹姆斯·布莱克，只了解黑衣组织成员称呼灰原为“雪莉”（TV 345、425、563），但没有表示他们已经确信灰原就是原组织成员，也没有表示他们知道“雪莉”的真实姓名、年龄等信息。
