清朝同治年间陕甘地区爆发回变，左宗棠临危受命督办陕甘军务。左宗棠采取的战略方针核心是“先捻后回”、“先秦后陇”，关键则是“不令捻回合势”。 左宗棠抵达陕甘地区后，采取严厉的铁腕措施，对参与暴乱的回民格杀勿论。剿抚并用，恩威并施，终于取得陕甘地区控制权。 左宗棠认为匪首马化龙反复无常且屠杀汉人不下百万，且之前曾投降后又叛乱。于是夷了马化龙三族，另一悍匪白彦虎逃跑， 陕甘回乱才算真正结束
陕甘之乱的结局是左宗棠平定陕甘之乱。
1862年，由于对清廷不满，汉回之间的民族冲突，加上满清的腐败和欺压，回民爆发起义太平天国被灭后，左宗棠率军开始对陕西甘肃等用兵。 这场战争极大让陕甘两省锐减。陕西方面：战乱重灾区的陕西同州府，由道光三年的180多万，到光绪六年的80多万，人口锐减百来万。
甘肃方面：13个府州中除阶州因地处边远．受起义影响较小外．其他12个府州都是战争的中心区域，有大量的人口损失。 此据《中国人口史》一书的统计，单单甘肃人口损失达1455.5万人。
