孔府作为中国传统文化的重要代表之一，历史悠久，经历了多次劫难和重建。根据历史记载，孔府被毁灭过至少三次。
第一次是在孔子去世后不久，秦始皇焚书坑儒时，孔府被毁。当时，秦始皇下令焚烧儒家经典，坑杀儒生，孔子的后人为了保命，不得不将孔府迁至鲁城（今山东曲阜），但孔府的建筑和书籍都被付之一炬。
第二次是在南北朝时期，孔氏后人因战乱迁至江南，孔府再次被毁。由于战乱和天灾，孔氏后人被迫离开山东，前往江南避难。在江南期间，孔府的建筑和书籍再次被毁。
第三次是在明末清初时期，孔府又一次遭受了劫难。当时，清军入侵中原，大肆烧杀抢掠，孔府再次被毁。孔氏后人不得不将孔府再次迁至鲁城（今山东曲阜），重新进行修建和恢复。
虽然孔府经历了多次劫难和重建，但它的历史和文化价值依然不减。如今，孔府已经成为中国传统文化的重要代表之一，吸引了无数游客前来参观和朝圣。
孔府在历史上没被毁灭过。
