1、手动采摘。一般来说木耳菜会在秋季时结出种子，这个时候就可以进行采摘，而木耳菜的种子成熟之后外壳会比较坚硬，并且呈现褐色。所以在采摘过程中也极为方便。
2、清水清洗。木耳菜种子在采收完成之后不要立马储存，首先要将其放在清水中进行清洗，直到外壳颜色洗掉为止，此过程可能要清洗两遍。采取这样的方式也是为了挑选优质的种子，没有萌发力的种子它就会漂浮在水面，而质量较好的种子则会沉入水底。
3、阴凉晒干。当清洗完木耳菜的种子之后，要将表面的水分中蒸发干净，这样才可以储存。如果觉得太过麻烦，也可以直接放在阴凉通风的地方进行晾干，等到种子完全干燥之后就可以进行储藏。
4、装袋储藏。木耳菜种子在采摘之后不要立马种植，首先要放在一个塑料袋中进行储藏，等到春季到来时就可进行播种，这样非常利于种子的萌发。除此之外也可以将它放在阴凉干燥的环境中，只要保持温度在5℃即可。
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