乌龟用肺呼吸，且肺部十分发达，能吞入大量空气，因此在水中不至于被闷死。
而且，它的泄殖腔两侧的肛门囊，可在水中进行气体交换，所以它在水中长时间也不至于被“淹”。
乌龟的身体构造因具有硬壳龟甲，所以呼吸的方式跟一般生物呼吸方式大异其，它呼吸的方式是藉由头部颈部及四肢的伸缩来完成呼吸作用的。
肺部有一条肌肉连接着前脚，当前脚前后摆动时拉动肺部肌肉使空气进入肺部完成吸气的动，之后另一条肌肉会挤压内部器官将废气排，如此周而复始完成乌龟的呼吸作用。
所以各位会发现乌龟纵使在休息时(腹甲贴在地面)甚至在睡觉时前脚仍会不自主的摆动，其实就是在呼吸(睡觉也要呼吸)。
