一、表示含义不同
1、主效应表示在有一个或几个因子(自变量)的多水平的实验中，描述一个因子在各水平上对反应量(因变量)影响大小的度量。
二、简单效应表示一个因素的不同水平在另一个因素的某个水平上的效应。
（2）考虑因素个数不同：
1、主效应：在考虑某因素的主效应时，需要考虑除所有因素的效应。
2、简单效应：在考虑某因素的简单效应时，需要考虑该因素的效应，除该因素以外的其他所有因素保持在同一水平。
概念含义
简单效应是一个因素的不同水平在另一个因素某个水平上的效应，当一个因素在另一个因素的不同水平上产生不同效应的时候，就出现了交互作用（interaction effect）。当然每一个因素可能会有自己的主效应（main effect）。在出现交互作用之后，需要进一步考察简单效应（simple effect）。即是考察A1在B1上的效应，A2在B1上的效应，以及A1在B2，A2在B2上的效应。
