现在济宁市共分为两个市辖区，分别为任城区和兖州区。
任城区，位于鲁西南平原，京杭大运河中段，京杭大运河穿境而过，相距济宁曲阜机场15公里。是济宁市的政治、经济、文化中心，济宁市组群城市核心区。2014年政府官网统计任城区辖2个镇、13个街道和1个省级经济开发区，分别是：阜桥街道、古槐街道、金城街道、李营街道、仙营街道、观音阁街道、越河街道、济阳街道、南苑街道、喻屯镇、唐口街道、安居街道、南张街道、长沟镇、二十里铺街道和任城经济开发区。89.2万人口，总面积651平方公里。2019年10月，入选2019年度全国综合实力百强区、 2019年度全国科技创新百强区 、2019年度全国新型城镇化质量百强区 、2019年度全国投资潜力百强区 。
兖州区，地处鲁中山地泰沂山区西南部的山前倾斜平原，北邻宁阳，西靠汶上，南、西分别与邹城、任城接壤，东隔泗河和孔子故里曲阜毗邻。4000多年前夏禹划天下为九州，兖州为其一；2000多年前孔子、孟子、曾子等曾在此讲学；“诗仙”李白曾寓家在此。2013年10月18日，撤市设区，兖州市改称兖州区。兖州区辖5个街道、7个镇：鼓楼街道、龙桥街道、酒仙桥街道、王因街道、黄屯街道、新兖镇、兴隆庄镇、大安镇、漕河镇、小孟镇、新驿镇、颜店镇。截至2015年，人口54.78万人。2017年12月14日，获评中国工业百强区。2019年10月，成为全国综合实力百强区排行榜（全国百强区）第67名。第二批节水型社会建设达标县（区）。
