强调科学的目的在于造福人类，使人成为自然界的主人和统治者。
反对经院哲学和神学，提出怀疑一切的“系统怀疑的方法”。
还提出了“我思故我在” 的原则，强调不能怀疑以思维为其属性。
笛卡尔的自然哲学观同亚里士多德的学说是完全对立的。他认为，所有物质的东西，都是为同一机械规律所支配的机器，甚至人体也是如此。
同时他又认为，除了机械的世界外，还有一个精神世界存在，这种二元论的观点后来成了欧洲人的根本思想方法。
笛卡尔最著名的思想就是“我思故我在”。意思是：“当我怀疑一切事物的存在时，我却不用怀疑我本身的思想，因为此时我唯一可以确定的事就是我自己思想的存在”。
