金刚菩提种类主要有两种：
一是南京金刚菩提，又称南京菩提子，产自中国南京，颜色深黑，质地坚硬，纹理清晰；
二是印度金刚菩提，又称印度菩提子，产自印度，颜色较浅，质地相对较软，纹理较模糊。两者的区别主要在于产地、颜色、质地和纹理。南京金刚菩提因其深黑色和坚硬质地而备受追捧，而印度金刚菩提则因其浅色和柔软质地适合雕刻。无论是南京金刚菩提还是印度金刚菩提，都被视为佛教信仰中的重要物品，具有辟邪、增福、保平安的功效。
一、纹路：金刚菩提一般分为肉纹和柴纹。顾名思义，柴纹就是指纹理较细，瓣线较干瘪。肉纹则相对肉质饱满，纹理较粗。相对来说，肉纹因其更易盘上手，更受玩家们的喜爱。
二、皮质：金刚菩提的皮质决定着其价值，一般来说，金刚菩提的皮质为成红皮和黄皮两种。而这两种皮质的主要差异就在红皮前期上色快，但后期盘玩效果没那么好，而黄皮上色相对较慢，后期盘玩出来的效果非常漂亮。
三、桩型：金刚菩提桩型主要有六种，常见的是高桩、圆桩和矮桩三种，其中高桩是指桩高大于直径，圆桩则是指桩高和直径相等或者差距较小，一般在2mm左右，矮桩就是指金刚菩提的直径比桩高要大，差距在4mm左右。
还有一种飞碟桩也属于矮桩的范畴，指桩高大于直径。
除了以上分类外，金刚菩提还可根据尺寸的大小，瓣数的多少等分类，这里就不多赘述。
