两者的区别就在于它们给人造成的状态不一样。醍醐灌顶：比喻和形容给人灌输智慧，使人彻底醒悟的意思。其中醍醐是从牛奶里提炼出来的精华。佛教比喻是最高的佛法； 茅塞顿开：比喻原来被堵住的情况，在什么力量的作用下，突然开通了的状态。形容人对什么问题忽然的理解和领会，例如：经过老师的指点，我茅塞顿开，这道题我会做了！
醍醐灌顶指的是佛教指灌输智慧，使人彻底觉悟。比喻听了高明的意见使人受到很大启发。也形容清凉舒适。茅塞顿开指的是原来心里好像有茅草堵塞着，现在忽然被打开了。形容思想忽然开窍，立刻明白了某个道理。
醍醐灌顶多指更进一步的明白，而茅塞顿开则是突然开窍，之前没有基础的明白。
