区别是两者建立者不同，并且吐谷浑最后是被吐蕃灭亡的。
吐谷浑（313―663），亦称吐浑，中国古代西北民族及其所建国名。本为辽东鲜卑慕容部的一支，藏族人民称之为阿柴。是西晋至唐朝时期位于祁连山脉和黄河上游谷地的一个古代国家。
吐蕃是7～9世纪时古代藏族建立的政权，是一个位于青藏高原的古代王国，自囊日论赞至朗达玛延续两百多年，是西藏历史上创立的第一个政权。
吐蕃是以今天西藏为中心，藏族为主，包括青海、四川一部分。
吐谷浑属于蒙古草原上的鲜卑族慕容部落，东汉末年至隋唐之际，中国历史上有“五胡乱华”之说，国土主要分布在青海、甘肃一带，历史上与唐朝交好。
吐蕃与吐谷浑属于同时期的陆上邻国，都属于少数民族政权。
