1、体型不同，青蚯蚓为本土原生的物种，体型长得较大；而红蚯蚓是外来经过人工培育后的一个物种，一般体型都不会很大。
2、除了用来垂钓和当饵料，这两种蚯蚓都有一定的药用价值，相对的青蚯蚓作为一个古老的原生物种，药用和其它方面的用途比红蚯蚓更为悠久广泛。

3、从垂钓方面来看，红蚯蚓因其体型适中，便于挂钩，直接用于垂钓比较方便，适合钓各种鱼类；另外红蚯蚓能在水中存活更长时间，肉质也更加有劲道。相对的青蚯蚓体内泥土类的废物过多，肉质因此更加疏松，并且在水中存活的时间也相对更短，长时间使用就会失去诱惑力，不利于垂钓。
4、在实际的垂钓中，青蚯蚓大多用于垂钓体型较大的鱼类，像鲤鱼、青鱼草鱼和鲶鱼之类的，因其体型更大，腥味也相对更浓烈持久，对这类鱼有着比较强的吸引力。而红蚯蚓基本没有什么限制，几乎只要是肉食和杂食的鱼类都可以用来作饵，可以说红蚯蚓是一种万能的鱼饵。
