西红柿内种子发芽这一现象是一种正常现象。因为植物果实里的种子都有个休眠期，过了休眠期后，在温度、空气、水分条件适合的情况下就会发芽。
采用低温来储藏番茄,会诱导脱落酸含量的下降以及赤霉素含量的上升。因此，经过长期低温储存过的番茄，一旦拿到较为温暖的环境中，里面的种子更容易萌发。番茄内部种子发芽，是果实过熟的一种表现，和植物生长调节剂的使用并无直接关系，也非受到辐射或转基因所致。不过，考虑到营养和口感，遇到这种情况，并不建议食用。
番茄籽发芽了，可以吃。
1、番茄里长“豆芽”的原因应是番茄籽发芽了，属于个体变异。
2、这种自然生长的情况比较少见，番茄一般是五六月份用籽种育苗，待生长到一定程度，再移栽到田里生长，但这种不经专门培植也发芽生长的现象，属于个体变异。
3、虽然番茄长芽较为罕见，但按种子的发芽规律也是可以的。这种情况一般是番茄放置时间过久，番茄内部的水分充足，久放后种子度过了足够的休眠期，种子的胚乳为其发芽提供了充足的养分，再加上有少量阳光透入，就会引起发芽。
