有区别。高差是两点之间的高低相差的意思，而高程是某一点的绝对高程。高差是某一点高于或低于某一点的差值。高差一般在工程建设领域使较多，为了测出高差后以便挖高填低，或利用高差确定水电站发电装机。高程是指以黄海基准面为零到大地上任意一点的高度，这个高度值就是绝对高程。
两者区别如下：
一、指代不同
1、高差：是两点间高程之差，即终点高程减起点高程。
2、高程：相对于不同性质的起算面（大地水准面、似大地水准面、椭球面等）所定义的高程体系。
二、测量方法不同
1、高差：正高系统以大地水准面为高程基准面，地面上任一点的正高系指该点沿垂线方向至大地水准面的距离。
2、高程：利用水准仪提供的水平视线，观测垂直竖立在两点上的水准标尺，以测定两点间的高差，进而求得待定点高程的方法，是一种精密的高程测量方法。
三、特性不同
1、高差：高程测量方法测出未知高程的点时，先从已知高程点测出两点的高差，再计算出未知高程点的高程。未知点比已知点高，两点的高差为正，反之为负。
2、高程：程以椭球面为基准面，是由地面点沿其法线到椭球面的距离。大地高程可直接由卫星大地测量方法测定，也可由几何和物理大地测量相结合来测定。
