一、对象不同： 会计监督的对象是资金流动，从其纵向即运动过程而言，包括事前监督(如预测和计划)、事中监督(如日常控制)和事后监督(如检查、审核)。它伴随着经济活动而进行，贯穿经济活动的始终。 审计监督的对象是反映经济过程、经济现象的会计资料和其它经济资料，重点审查这些资料是否真实、合法、有效。它以查账为中心，对会计工作进行检查。
二、方法不同： 会计监督是运用专门的方法，即对经济业务进行计量、记录、分类和汇总，通过填制凭证、登记账薄和编制报表，从而形成会计资料即会计信息。这种会计信息可提供给有关人员进行管理和决策。 审计监督的方法是研究、分析、调查和评价，按照一定的程序，如出具审计通知书、制定审计工作方案、编写审计工作底稿、撰写审计报告等，通过审计，查明会计资料、其它经济资料以及它们所反映的经济活动是否真实正确，是否合理合法，是否经济有效，并提出审计意见和结论。
三、职能作用不同： 会计监督是会计的基本职能之一，它是对资金运动进行的管理工作，其主要作用在于控制经济活动，促进经济发展，正确处理国家、集体和个人三方面的关系。通过对资金的会计监督，达到正确合理地组织、分配和使用资金，降低费用和成本，增加积累，不断提高资金使用的经济效益。 审计监督作为一项独立的经济监督活动，其主要作用在于通过对会计资料的检查，监督财务收支，维护财经纪律，保护财产安全完整。它一般是通过检查来确定会计资料的正确性、完整性和合法性，进而审查财务收支，检查错弊，堵塞漏洞，提高效益。
