1、净度不同
宝石和水晶的净度不同，水晶的存世量和开采量较大，且较为常见，市场上对水晶品质的要求较为严苛，水晶的包裹体种类较多。人们通常对宝石的净度没有严苛的要求，宝石的净度一般较好。
2、含义不同
宝石和水晶的含义不同，两者之间有明显的差别，水晶是具体的一种物质，在自然界中较为常见，而宝石的定义宽泛并不具体，通常指经过打磨抛光等加工雕刻制作而成的珠宝玉石，不单指某一类物质。
3、产地不同
宝石和水晶的产地不同，不同宝石的产地不同，且宝石的概念较为宽泛，以钻石为例，钻石的产地主要分布在澳大利亚、南非、俄罗斯和加拿大等国，而水晶主要产自中国、美国、巴西、加拿大等国。
水晶与宝石区别是:
宝石是一个统称，有许多种，例如猫眼石、祖母绿、红宝石、蓝宝石等等。 钻石是碳元素构成的，刚玉是三氧化二铝，含不同的金属氧化物就形成红宝石或蓝宝石，硬度不如钻石；
水晶是二氧化硅，和砂子的成分一样，也叫石英，硬度最小。颜色跟它们内部含的成分有关，一般是金属氧化物，也跟切割的外形有关，可以利用不同的面间的光线折射，形成不同的颜色。
