1、建立王国的民族不同。
古巴比伦王国由阿摩利人建立，新巴比伦王国由迦勒底人建立。
2、王国创立时间不同。
古巴比伦王国公元前21世纪下半叶至公元前16世纪初存在的国家，距今5000年左右时间。
新巴比伦王国是公元前626年至公元前539年存在的西亚国家，于公元前539年被波斯帝国灭亡，新巴比伦与古巴比伦之间间隔千年的历史长河。
3、文明及政治制度不同。
古巴比伦文明是世界上最早的美索不达米亚文明逐步发展而来，是“四大文明古国”之一，制订了世界上古代的第一部比较完备的成文法典《汉谟拉比法典》，实行中央君主集权制度，在古巴比伦时期铸造、冶金技术、铁犁、货车及战车等被先后发明，是巴比伦文明的鼎盛时期。
新巴比伦王国时期实行了君主制政治手段，延续了亚述帝国时期让奴隶独立经营的剥削方式，是两河流域历史上奴隶制经济最繁荣的时期，新巴比伦王国的灭亡，标志着两河流域历史独立发展的完结。从此它被一个个的外族入侵和统治，直至公元7世纪阿拉伯人入侵并统治这里。
4、王国征服统一的历程不同。
古巴比伦王国自汉谟拉比时期开始统一两河流域，采取灵活务实外交，一个时期集中力量攻灭一国，先后灭了伊新、拉尔萨、马里等城邦。征服活动大约进行了35年，除了北方强悍尚武的亚述和它庇护下埃什嫩之外，两河流域已基本统一在汉谟拉比的铁腕下。
新巴比伦王国与伊朗高原的米底王国联合反对北方亚述的统治，共同对抗亚述。亚述帝国结束后新巴比伦王国分取了亚述帝国的西半壁河山，即两河流域南部、叙利亚、巴勒斯坦及腓尼基。
