生物菌肥是一种有效的肥料，对果树施肥效果最好。它能加速腐熟，增强有机质分解能力，提高土壤透气性。
在果树施用生物菌肥时，可以从定植坑向外扩展40～50厘米，将有机肥与表土拌匀后施入，然后逐年秋季进行扩穴施肥，直到株间相连。
果园面积较大时，可秋季全园撒施，结合菌肥施用，进行机械深翻20～30厘米。生物菌肥能够满足果树对营养的需求，且不会导致树势衰弱和大小年现象，是一种理想的肥料。
磷酸二氢钾系磷钾高效复合肥，它具有促进农作物光合作用，迅速补充土壤有效营养元素，提高土壤肥力，易为作物吸收利用，增强作物抗寒、抗旱、抗病虫害能力，改善作物品质等功能。具有用量少、肥效高、易吸收、见效快、使用方便、增产效果显著等特点。是无毒、无害、无残留的绿色肥料，近年来被广泛应用于果业生产。
桃：桃成果后，每隔10天喷施0.3%～0.4%的磷酸二氢钾3～4次，可以提高产量、增进品质的效果。
葡萄：坐果期与果实生长期喷3～4次0.3%～0.4%（每100公斤的水和300～400克的磷酸二氢钾）的98%磷酸二氢钾，可提高产量、增进品质的效果。此外磷酸二氢钾也可以作为冲施肥，溶于水中，浇灌在葡萄植株下，溶解浓度为0.2%，每个植株浇灌500毫升左右。
苹果：果实套袋后，每7～10天喷施300～350倍的磷酸二氢钾，补充树体营养，增强光合作用，更能使果实及时得到养分补充和获得的养分全面，效果更好。果实采收后，每隔半月喷一次0.5%尿素和0.3%磷酸二氢钾，可结合病虫害的防治进行。
梨：梨套袋后，追肥上应该注重磷钾肥，磷酸二氢钾每隔15天喷一次，浓度为0.2%～0.4%，同时可以与尿素，硼砂混合喷施，可显著提高品质与产量。
草莓：初花期和盛花期喷0.2%硫酸钙加0.05%硫酸锰（体积1:1），可提高产量及果实贮藏性能。花期前后叶面喷施0.3%尿素和0.3%，98%磷酸二氢钾3～4次，可提高坐果率，并可改善果实品质，增加单果重。
