因为张居正属于一代权臣，皇帝不可能会善待他。当年小皇帝年幼，没办法主理朝政，一切都是张居正做主，这也使他能权倾朝野。
再者张居正作为“帝师”对小皇帝的严加管教，让小皇帝有很多心灵阴影。
他自己高而盖主，贪恋权力，不能及时抽身，引发万历猜忌和不满；朝中改革铁血手腕，触动大部分官员利益，而自身性格刚愎自用，不能看清形势，引发了无法善终的悲剧。
大明王朝首辅大臣张居正是明朝唯一的大政治家，是汉朝以来只有王安石和诸葛亮二人，勉强于他相比，张居正身为帝师，为了给大明王朝培养出一代明君，他对小皇帝过于严格和苛责。
明明是让万历皇帝成为合格的君王，而万历皇确不这样认为，还有张居正居功自傲，有以下欺上的姿态，在君要臣死，臣不得不死的封建社会，给自己埋下杀身之祸，随着万历皇帝亲政，就是清算他的时候到了，所以不得善终。
