一、大蒜种的问题
蒜种的蒜瓣受伤。群众有句俗话：蒜瓣“不怕冻，就怕动”，蒜瓣一挪动容易受伤而烂根。
二、是保管不善
收种时蒜头淋雨发霉，有铁锈色的根，这种蒜瓣也容易烂根。
三、水分管理不当
很多农民朋友看到地干天旱，喜欢大量浇水，但是浇水过大，容易沤根。在24小时淹水的情况下，根系会产生无氧呼吸，导致根系受害，严重的会死亡。根系初为黄色，后变黑。病菌侵染导致烂根。
四、肥料管理不当
土壤有机质含量不高，导致植株抗逆性下降。通过调查，发现大部分蒜农基本上都不用有机肥，全是以化肥为主，这也是导致大蒜抗逆能力下降，病虫发生严重，产量不高，品质下降的一个主要因素。土壤板结，再加上重茬严重，及有机肥料和中微量元素肥料严重匮乏，这也是大蒜之所以不高产、不优质的主要因素。建议用嘉美红利、嘉美海力宝交替冲施，疏松土壤，增加土壤通透性，提高地温，促进根系生长，增强吸水吸肥能力。
五、病害导致
常见的有根腐病、软腐病，这两个病害都是导致烂根的主要病菌。尤其重茬地块更严重。大蒜产区连续种植大蒜的重茬地普遍在，致使大蒜的病害发生严重，直接影响着大蒜的品质和产量。其次对害虫管理不及时也会引发病害侵染，导致烂根。如地老虎、蝼蛄、蛴螬、韭蛆、蓟马等害虫危害后也会导致病菌侵染。
