敦煌市辖7个镇、2个乡：沙州镇、肃州镇、莫高镇、转渠口镇、七里镇、月牙泉镇、郭家堡乡、黄渠乡、阳关镇；国营敦煌农场、青海石油管理局生活基地。沙州镇为市委、市政府所在地，是全市政治、经济、文化的中心。城西7公里处的七里镇是一座新型的石油城，现为青海石油管理局所在地和青海油田后勤生活基地。
敦煌市本身就是一个县级市，属于县级行政区，不会下辖区、县的，所以严格来说敦煌市没有“区”。
敦煌市辖7个镇沙州镇、肃州镇、莫高镇、转渠口镇、七里镇、月牙泉镇、2个乡郭家堡乡、黄渠乡、阳关镇。敦煌文化灿烂，古迹遍布，素有“东方艺术明珠”之称，有莫高窟、榆林窟、西千佛洞等主要景观。
