水的污染物大致可分为生物污染、无机污染、有机污染三大类。现在，饮水安全的最大隐患来自有机污染，有机污染来源非常广泛，工业污染排放、化肥农药等农业污染和人们的日常生活，都有可能对水体造成有机污染。这些有机污染物存在巨大的潜在危害性。
水体污染按污染物种类分为：有机污染、重金属污染、化肥和农药污染、热污染、石油污染、放射性污染、病原微生物污染。
有机污染：有机污染物有的有毒
重金属污染：危害较大的重金属有汞（Hg）、镉（Cd）、铬（Cr）、镍（Ni）、铅（Pb）、锌（Zn
化肥和农药污染：化肥中磷（P）、氮（N）大量进入水体将引起水体富营养化。
热污染：由工业排放的高温废水造成，主要影响水中生物的生存和繁殖。
石油污染：多发生在海上，主要影响海洋生物。
放射性污染：水中放射性污染物可附着在生物体表面，也可被吸入生物体内积累起来。
病原微生物污染：来自生活污水、饲养场、制革工业、医院等的废水中的病毒、病菌、寄生虫等污染水体后，可传播疾。
