两者的区别主要是：
一，职位不一样：董事长是公司法定代表人、主要负责人、公司的一把手；总经理不是。
二，职责不一样：董事长主持董事会工作，向股东大会负责；总经理在董事会领导下，负责公司日常经营活动，向董事会负责。
三，职权不一样：董事长对公司人、财、物和重大决策有临机决断权；总经理作出的重大决策必须董事长同意。
国企董事长管决策，总经理助理负责执行董事会决策和企业的经营管理，这是董事长和总经理职权分工的区别，也是权利分配的基本原则。但一些中小企业分工并不是很明确，董事长参与经营管理的情况很常见。
