1.种属不同：
鸬鹚：属于鸬鹚科鸬鹚属的一种大型水禽。
鹈鹕：属于鹈鹕科鹈鹕属大型游禽。
2.外形差异：
鸬鹚：羽色黑亮，喙锥状，前段弯曲。
鹈鹕：体型大，喙长，喉囊发达。
鸬鹚和鹈鹕的主要区别是：科目分类不同、形态特征不同、生境分布不同。
科目分类不同
鹈鹕，别名塘鹅，是鹈形目、鹈鹕科、鹈鹕属动物。鸬鹚一般指普通鸬鹚，别名黑鱼郎、水老鸦、鱼鹰，是鲣鸟目、鸬鹚科、鸬鹚属动物。
形态特征不同
鹈鹕体长约1.7米左右，翼展可达3米，体重可达13千克，嘴形宽大直长，上嘴尖端朝下弯曲，呈钩状；鸬鹚体长72-87厘米，体重大于2千克。通体黑色，头颈具紫绿色光泽，两肩和翅具青铜色光彩，嘴角和喉囊黄绿色，眼后下方白色，繁殖期间脸部有红色斑，头颈有白色丝状羽，下胁具白斑。
生境分布不同
鹈鹕主要栖息于湖泊、江河、沿海、沼泽地带、荒芜的岛屿，偶尔也光顾池塘和红树林。大多分布在亚洲、欧洲、非洲以及澳大利亚。鸬鹚栖息于河流、湖泊、池塘、水库、河口及其沼泽地带。亦常停栖在岩石或树枝上晾翼。分布于欧洲、亚洲、非洲、澳洲和北美。
