天麻籽保质期主要取决于天麻籽的保存方法，如果是新鲜天麻则保质期很短，大概3-5天。如果是原药材晒干密封，只要保证环境良好，足够的通风、干燥，在温度、湿度都非常适宜的情况下，只要不生虫、不霉变、不受潮都是可以入药的。当天麻籽被制成天麻粉，按照国家规定是有保质期的，最长不超过两年，以上是根据天麻不同状态的相应保质期。因此，在收藏天麻籽的时候只要注意不受潮，不受霉菌的侵袭，保持在一定干燥、通风状态下储存可以长期存放，但是要注意去翻看，一般问题不大。
天麻籽的保存方法最好是晒干，用塑料袋密封好，放在玻璃、陶瓷等容器里密封、低温保存。将密封好的天麻籽放置在冰箱冷藏，注意密封严实，以防止和其他食物串味或者进入水分，可以加入干燥剂防止天麻籽受潮。
