游戏一共有三个特殊结局和一般结局，但是故事的发展并没有分支，只有一条线。
一般结局没有特殊要求，只要有EXP并且没有灭绝所有怪物即可。最终BOSS是魔性小花
好结局要求不杀一只怪（即到sans的裁决时LV和EXP为零），触发三个约会事件，并完成真实验室。最终boss是Asriel Dreemurr
坏结局要求灭绝所有怪物（即该地区内无法再踩到怪），一路杀到最后，如果你选择这条线的话可以无视部分解密内容。最后的交易是永久的，除非换电脑或者重装系统否则无法撤消。如果你是正版玩家的话这个交易还会和账号绑定（STEAM云存档）。关于这个交易的存档单独保存在另外的文件里，steam云存档可以手动关闭
真结局要求先触发坏结局，接受交易，之后按照好结局的要求再玩一边。这个路线基本上和好结局差不多，只不过在过程中和结局中稍微有一点不同（红色字），另外多出了一些令人在意的细节。
在好结局的最后你可以选择留下来或者离开，这个会影响最后出现的是全家福还是一小段羊妈送派动画。
