1、购买时间不同：电子式国债仅在发行期内可以购买，而凭证式国债在发行期内或者发行期后都可以购买。
2、起息日不同：国债起息日会被很多投资者忽视。两种债券的起息日不同，电子式国债有统一日期开始计息，这就意味着，即使你是本月10日购买到的债券，起息日有可能在本月的15日；而凭证式国债的起息日则是从投资人购买之日开始计息。
3、购买渠道不同：凭证式国债和电子式国债的购买渠道和手续不同，电子式国债既可以去银行网点购买，也可以通过网银买。而凭证式国债只能通过银行柜台买。
4、付息方式不同：凭证式国债到期一次性付息，电子式国债每年付息，最后一年支付本金。
