说自交和回交的不同的话，可以从纯种的基因型种类来说：自交是多方向的纯合，回交是单方向的纯合。在基因型的纯合的进度上，回交显然大于自交。一般回交5-6代后，杂种的基因型已觉大部分被轮回亲本的基因组成所置换了。
除开从基因型的种类来说，还可以从基因的频率来区分：回交后代的基因频率将严格受其轮回亲本的影响，而自交后代的基因频率却是稳定不变的。回交可能回留有一些亲本的影响，可是对于自交来说，基因的本来始终不变，各占一半一半。

自交和回交一定程度上不单单是在动物身上能够体现，还能够从一些植物上能够体现。对于自交和回交都是一种常见的现象，毕竟动植物一定程度上都是需要繁衍，促使生命的意义能够继续。
