种类不同、果实、花朵、叶片不同。荔枝和龙眼在种类上完全不同，荔枝的果实外表呈红色，有很多小凸起在荔枝外壳上遍布，个头较大，果肉甘甜多汁。而龙眼的果实表皮为黄色，光滑没有小凸起。荔枝的花朵颜色为黄绿色，而龙眼的花朵颜色为黄白色。
荔枝和龙眼有什么区别
1、果实造型

荔枝和龙眼最大的不同就是在于两种植物的果实造型。荔枝的果实外皮呈红色或近似红色，有密集的小型凸起均匀遍布球体，一般比较大，果肉白色，而龙眼的外皮一般是黄色，非常光滑没有凸起，果肉是半透明的，有药味。
2、花朵外形
荔枝和龙眼在花期时所开出的花的造型也是不同的，荔枝树为聚伞花序，但呈圆锥状排列，花朵的颜色的黄绿色的，而龙眼树是圆锥花序但簇生，杂性，每朵花一般是有5片花瓣，花瓣的颜色大体呈现出黄白色或近似黄白色。
3、叶片形态
荔枝树的叶片一般是奇数羽状复叶，也有少数是偶数的，一般有小叶2-5对，对生或是互生，呈革质表面，椭圆披针形，边缘有刺，而龙眼树全部都是偶数羽状复叶，全部互生，薄革质，呈长圆披针形，前端为急尖或者稍钝。
4、种属不同
尽管都作为剥皮食用的多汁水果，但是龙眼和荔枝在种属上就是截然不同的两种植物，荔枝是无患子目无患子科荔枝属的常绿乔木所结出的果实，而龙眼是无患子目无患子科龙眼属的常绿大乔木所结出的果实，二者种属不同。
