二者的区别有多重
第一点，荧光笔顾名思义，颜色一般为亮色，吸引注意。马克笔则色彩多样，非常全面
第二点，荧光笔适合标记或者笔记使用，在纸上不会印到下面。而马克笔含有酒精，普通的纸会印到下面，需要专门的马克笔卡纸
第三点，荧光笔学生上学用的多，马克笔绘画漫画等使用较为合适
马克笔分为水性，油性,酒精性，油性马克笔快干、耐水、而且耐光性相当好，颜色多次叠加不会伤纸，柔和。
水性马克笔则是颜色亮丽青透明感，但多次叠加颜色后会变灰，而且容易伤纸。
还有,用沾水的笔在上面涂抹的话,效果跟水彩一样。有些水性马克笔干掉之后会耐水。
要去买马克笔时,一定要知道马克笔的属性跟画出来的感觉才行。
马克笔这个画具在设计用品店就可以买到,而且只要打开盖子就可以画,不限纸张、各种素材都可以上色。
荧光笔是近几年新出的做记号用的笔用较粗、较淡的墨水覆盖关键部位来做记号,做上记号后,不遮挡住文字一目了然。
其关键的紫外荧光油墨的原理是在油墨中加入具有紫外线激发的可见荧光化(络)合物。
通过吸收的光能，产生原子的能级跃迁，再释放吸收的额外能量。防伪特征是在紫外光(200nm～400nm)照射下发出红、黄、绿、蓝(400nm～800nm)的可见光。
此油墨有有色和无色之分，有长波(365nm)和短波(254nm)两种.荧光颜料是有机络合物，研磨细化，发光率高，通常是无色或浅白色，在紫外（200nm～400nm）照射下，方呈现出各种颜色的可见光（400nm～800nm）。
按激发光源的波长不同，又可分为短波紫外线激发荧光颜料（激发波长为254nm）和长波紫外线激发颜料（激发波长为365nm）。
荧光笔有荧光剂，它遇到紫外线（太阳光、日光灯、水银灯比较多）时会产生荧光效应，发出白光，从而使颜色看起来有刺眼的荧光感觉。
