1、三者定义不同。A、社会组织在社会科学中社会组织有广义、狭义之分。狭义的社会组织是为了实现特定的目标而有意识地组合起来的社会群体，如人类的企业、政府、学校、医院、社会团体等。社会学研究的社会组织主要指狭义的组织。B、非公组织全称为非公经济组织，是由（非公经济）公司、集团、商行、企事业单位、研究机构、慈善机构、代理商、社团、私募基金或上述组织的部分或组合。C、“两新”组织，是指新经济组织和新社会组织的简称。新经济组织，是指私营企业、外商投资企业、港澳台商投资企业、股份合作企业、民营科技企业、个体工商户、.混合所有制经济组织等各类非国有集体独资的经济组织。新社会组织，是指社会团体和民办非企业单位的统称。
2、三者概念大小不同。社会组织概念最大，它包括了“两新组织”和非公组织。“两新组织”次之，它的概念比社会组织小，但又比非公组织大些。非公组织概念最小，仅仅是社会组织和“两新组织”概念的一部分。
3、三者组织属性有区别。社会组织属性既有政治的、经济的、文化的、科技的，又有社会的属性。“两新组织”属性主要为经济和政治的属性，但也有一些文化的、科技的和社会的属性，但比社会组织少得多，不在一个量级上。非公组织则只有经济属性。
