水稻施肥原则应是有机肥、磷化肥作基肥，钾化肥主要作分蘖肥，氮化肥采用多次匀施，特别注意好壮苞、壮籽肥，在足穗的同时，大穗大粒。
基肥以有机肥为主。据测定，水稻的总吸肥量有50%-60%的氮素和70%的磷、钾来自土壤，施肥不足就会过多消耗土壤潜在养分而降低地力，增施有机肥是维护和提高地力的重要途径。
因此，水稻生产要强调积制土杂肥，发展养殖业多施栏肥、多种绿肥，推广撩穗收割和稻草还田等，使有机肥施用量占全期施肥量的40%。
种植水稻最好使用施用农家肥，水稻底肥最好在耕整前先撒施下田，或者是耙田之前撒施下去最好。合理施用水稻施肥有助于水稻高产稳产，不过，现在农民用户没有农家肥，如果没有农家肥的话，可以选择施用复合肥，施肥量要看土壤肥力，大体在每亩60至80公斤。后期追肥不能只用尿素，需要配合磷酸二氢钾一起使用。含氯复合肥就可以氮大约18-20磷大约8-12钾有的地方缺的有的地方是富钾地区（比如江苏东部沿海），这样的肥料40公斤在搁田后再配合使用点氮肥大概15-25公斤/亩就可以了。
