邓姓源于姒姓，是夏禹的后裔。夏禹曾孙，即第四个夏王仲康，封其有德行的一个儿子在古邓林之地，建立妫姓邓侯国，在今河南邓州南。
这个邓国前后存续了800多年，后来被商国武丁所灭。此后，邓国的遗民就以国名为姓。现在邓州西南30公里外还有邓林镇等古邓地地名邓姓发源于河南南阳古邓国，大举南迁于东晋之时，早於汉代播迁入闽、粤 。汉代中期，邓况自楚徙居南阳邓州。
东汉初，因族人为光武帝刘秀的中兴汉室立下大功及与东汉皇室的亲戚关系，一跃而成为东汉最显赫的家族。但至东汉安帝时，有人诬告邓弘等曾反对立安帝，引起安帝不满，因而使邓氏遭受了一次大的劫难。
此后，南阳邓氏不断外迁，有南至湖南、湖北者，也有西至山西、甘肃者。西晋末年"永嘉之乱"时，有南阳邓叔攸迁至福建宁化石壁乡，后又分支泉州等地。
东晋十六国时，中原邓氏大举南迁，分布於江南许多省份，以江西、江苏居多。总之，邓姓早期主要还是以河南省境为其繁衍的中心，其首先迁入的地方是今山东高密县一带。
与此同时，已有邓姓南迁入今四川、广东等地。至晋代，邓姓的子孙在北方已落籍于山东、陕西、山西、甘肃、安徽等地；在南方已迁居到今江苏、湖南、四川等地。
