1、起源不同：水果玉米起源于前哥伦比亚时期的中美洲和南美洲。中国是普通糯玉米的世界起源中心，栽培历史悠久。
2、分类不同：水果玉米从含糖量上分为普通型水果玉米、超甜型水果玉米、加强甜水果玉米。颜色有黄色、白色、双色、和纯白色四种。普通玉米照颜色可以分为白色糯玉米、黄色糯玉米、黑色糯玉米、彩色糯玉米。
1、价格不同
因为栽培的方法不同，所以水果玉米的价格比较贵；普通玉米的价格较便宜，更适合大众消费。
2、外观不同
水果玉米的颗粒通常是黄色的，且非常饱满，水分很足；普通玉米一般都是白色的或是花色的，只有老玉米是黄色的，颗粒也比较硬。
3、产地不同
水果玉米原产于中美洲和南美洲；普通玉米的产地是在中国。
