土壤水分、温度和有机质含量对枯草芽孢杆菌的生长繁殖均有影响，一般情况下，适宜植物生长的条件和环境也适宜枯草芽孢杆菌的生长和繁殖。
反之，干旱、低温和有机质匮乏对枯草芽孢杆菌的生长繁殖不利。
一、土壤温度
枯草芽孢杆菌在土温10-40℃范围内能够正常生长繁殖，在10-24℃生长繁殖较缓慢，并随着温度增高而繁殖加快，25-37℃最适宜生长繁殖，在碳源充足（也就是有机质丰富）时约20--30min繁殖一代，超过48℃后生长繁殖受到抑制，但也能繁殖，在60℃条件下可长期存活，在120℃条件下可存活20min。
二、土壤湿度
水分是枯草芽孢杆菌生长的先决条件，在缺少水分的条件下，枯草芽孢杆菌表现为芽孢状态（休眠），不能生长和繁殖。
在土壤湿度低于15%时，枯草芽孢杆菌不能正常生长和繁殖。
在土壤湿度15-30%时，枯草芽孢杆菌可生长繁殖，当土壤湿度在30-45%范围内最适宜枯草芽孢杆菌的生长繁殖。
实际上，当土壤湿度大于45%时，并不影响枯草芽孢杆菌的生长和繁殖，但是这个湿度条件往往对农作物不利。
