1、性质不同，初级即初级会计，初级会计证书属于会计职称类证书，注册会计师，注册会计师证书属于职业资格证书。
2、考试科目不同，初级会计职称考试科目包括《初级会计实务》和《经济法基础》；注册会计师考试科目专业阶段包括《会计》、《审计》、《财务成本管理》、《公司战略与风险管理》、《经济法》、《税法》，综合阶段科目为《职业能力综合测试》（试卷一、试卷二）。
3、发展方向不同，初级会计可以从事国家机关、社会团体、企业、事业单位的出纳、会计助理、会计等初级财务人员；注册会计师可以就职于会计师事务所、企业、事业单位财务、投行分析师
