唐天宝15年，安史之乱，安禄山攻破潼关。后潼关沦陷，一代名妃杨玉环逃亡，东渡日本（扶桑），更名辉夜姬。（3CD完整版光盘有此剧情，2CD和单张盗版光盘不含此剧情。）
与此同时，成长在江南水乡、水性极好的少年杨别，与相依为命的父亲靠捕鱼和在石竹林采药为生。某天夜晚，在采石村后的小南河，偶然救下了一个被江南名医（即药王孙思邈）的同门叛客追杀的苗疆族女子，随后药王的同门弟子追杀至采石村，之后杨别父子被卷入纷争和战乱，从此父子俩无奈背井离乡，手持一杆烟雨，笑傲十丈红尘，在中唐的乱世里，悠然走着属于他们自己的，追寻天河之路。
