细胞质可分为细胞质基质和细胞器两部分。
细胞质是细胞质膜包围的除核区外的一切半透明、胶状、颗粒状物质的总称。细胞质的主要成分为核糖体、贮藏物、多种酶类和中间代谢物、各种营养物和大分子的单体等，少数细菌还有类囊体、羧酶体、气泡或伴孢晶体等。
细胞质包括基质、细胞器和包含物，在生活状态下为透明的胶状物。
基质指细胞质内呈液态的部分，是细胞质的基本成分，主要含有多种可溶性酶、糖、无机盐和水等。 细胞器是分布于细胞质内、具有一定形态、在细胞生理活动中起重要作用的结构。
它包括：线粒体、内质网、内网器、溶酶体、微丝、微管、中心粒等。
