1、品种区别：锦鲤是属于鲤科的，它们的原产地是日本，主要有白色、黑色、红色三种。而锦鲫属于鲫鱼，它们又被叫做草金鱼，是我国本土产的。颜色比较多，有红色、白色、黑色、黄色等。
2、外形区别：锦鲤和锦鲫虽然名字比较相似，但它们的长相和体型都是有区别的。首先就是嘴巴，锦鲤的嘴巴是朝下的，而且锦鲤有胡须。锦鲫的嘴巴是朝上的，没有胡须，但有的锦鲫头部会有肉瘤。其次就是尾巴，锦鲫的尾巴比较大，游动起来比较优美，锦鲤的尾巴比较小。最后就是体型，锦鲤的体型比较圆也比较胖，体长可以达到50厘米以上，锦鲫的体型都是瘦长的，体长最多可以达到30-40厘米。
锦鲤要比锦鲫大很多，锦鲤可以长到1米多，锦鲫要比锦鲤小很多，锦鲫长到30公分已算很大了，因此锦鲤的体长最大为1米多，锦鲫的体长最大为30厘米。
锦鲤身体细长，比较像擀面杖。锦鲫身体短而宽，从背脊到腹部的距离比较大，夸张点的话有点像球拍。
锦鲤的嘴朝下，嘴上有两对不一样长的胡须。锦鲫的嘴朝前，嘴上没有胡须。所以锦鲤和锦鲫只要看有没有胡须就一下子分出哪个是锦鲫那条是锦鲤了。
