阿米巴会计的划分为三个部分：经营会计、管理会计、财务会计。
阿米巴经营包括经营哲学、组织划分和经营会计三大部分。经营会计是在细化组织，化小了核算单元，让每个阿米巴独立经营。每个阿米巴之间的收支独立核算，用经营会计协助全体员工参与经营管理，实现“全员参与”的赋权式经营方式，同时让经营者通过会计核算报表能够及时、清楚地掌握企业经营情况。
阿米巴会计学分为三个部分：经营会计，管理会计，财务会计，香港人文比佛利管理咨询机构的李哲贤博士就阿米巴会计学做了详细的解释。
1、阿米巴经营会计是阿米巴会计学的一个会计分支，阿米巴根据经营数据反映企业的真实经营状况，让所有阿米巴成员都掌握每天的经营实况，能帮助经营者即时作出决策。经营会计只是一种报表,即是每日单位时间效益核算表。通过阿米巴经营报表的分析, 提供经营报表的及时性，在经营会计报表中才体现出即时性。对于管理会计与财务会计的不同点在于阿米巴经营会计具有真实的日报表、周报表、月报表组合。对企业内部的报告存在真实性，而传统的会计报表是对企业内对外的报告，真实性相对较低。阿米巴经营会计的格式一样，内容一样，分析方法也是一样。分为三种分析法：还债能力、运营能力、内部定价毛利润的核算能力。定制阿米巴经营目标有此类数据组成。2.阿米巴管理会计又称内部报告会计，是阿米巴会计学的一个会计分支，对各级阿米巴经营数据进行加工、整理和报告，让管理干部对日常发生的各项经营活动进行规划与控制，能配合经营者作出决策。管理会计报表包含行政考勤表，销售报表、财务报表等。虽然管理会计在时间管理上存在相对的滞后性，且灵活性较低，在监督过程中需要花大量的时间去查阅与审核。但是管理会计却具有效的监控作用，在企业中必不可少。3.阿米巴财务会计又称对外报告会计，是阿米巴会计学的一个会计分支，反映企业财务状况、经营结果和现金流量的核算监督系统，可以满足企业内外有关方面的决策需要。
