135 黑暗组织十亿元抢劫事件(宫野明美下线)
136-139 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件(灰原哀登场)
190-192 与黑暗组织的再会(啊~雪莉 / 第一次变回宫野志保)
236-238 名侦探齐聚一堂!工藤新一VS怪盗基德(首次提及乌丸莲耶)
贝尔摩德篇
181-182 黑暗中的死角(【候选人】新出医生初登场)
245-246 战斗游戏的陷阱(【候选人】茱蒂老师初登场)
249-250 神秘的乘客(【候选人】赤井秀一初登场)
277-278 来自芝加哥的男人(詹姆斯初登场)
332-333 残留下来的无声证言(收到组织威胁的板仓卓)
334-336 接触黑色组织(柯南冒充板仓卓交易险被发现)
365-366 隐藏在厕所中的秘密(宫野艾莲娜的录音带)
371-375 与黑暗组织直面对决 满月之夜的双重谜案(贝尔摩德身份揭晓)
376-377 找寻臀部上的记号(小哀拒绝FBI证人保护计划)
红与黑的对决篇
459-463 黑色冲击!组织之手逼近的瞬间(水无怜奈初登场)
467-468 无法回头的两个人(本堂瑛佑初登场)
502-505 黑暗组织之影
527-528 黑色相片的下落(本堂瑛佑父亲照片)
538-551 红与黑的碰撞(水无怜奈身份揭晓)
波本篇
556 红白黄色和侦探团(【候选人】冲矢昴初登场)
614-615 侦探团VS抢匪团(“伤疤赤井”初登场)
629-632 引发危机的红色前兆/黑色13的暗示/步步逼近的黑色期限/摇曳的红色目标
697-698 幽灵饭店的推理对决(【候选人】世良真纯初登场)
719-720 婚礼前夕(【候选人】安室透初登场)
742-743 工藤优作的未解决事件(冲矢昴知道柯南真实身份)
751-752 迫近灰原秘密的黑影(第二次变回宫野志保)
753-756 漆黑的神秘列车(波本身份揭晓)
绯色篇
757-758 密室中的柯南/揭开谜底的波本(安室透怀疑沉睡的小五郎)
774-775 又甜又冷的宅急便(冲矢昴、安室透出场)
783-784 现场的邻人是前男友(羽田秀吉初登场)
786-787 茱蒂的回忆与赏花的陷阱(柯南与茱蒂交流情报被窃听)
812-813 恋爱小说的意外结果(领域外的妹妹初登场)
823-824 气氛僵硬的茶会(安室透调查楠田陆道死因)
832-836 绯色的序章/追寻/交叉/回归/真相(安室透、冲矢昴身份揭晓)
朗姆篇(连载中)
845-846 三个第一发现者(朗姆身份线索)
865-867 县警的黑暗(【候选人】黑田兵卫初登场)
891-892 关系不好的女子乐队(回忆中的苏格兰威士忌)
916-917 与17年前同样的现场(羽田浩司案相关)
918-919 灵魂侦探杀害事件(琴酒最近一次出场)
921-922 背叛的舞台(安室透与赤井秀一的恩怨来由)
936-937 涟漪中的魔法师(赤井一家)
944-945 新老师的骸骨事件(【候选人】若狭留美初登场)
949-950 隔壁的江户式推理秀(【候选人】胁田兼则初登场)
951-952 手臂白皙的女人(朗姆三选一)
964-965 燃烧帐篷的怪物(黑田VS若狭)
998-999 寻找玛丽亚(BOSS身份揭晓)
1009-1011 充满谜团的鸡尾酒(红茶会谈)
长野县三人组
564-566 风林火山 迷宫的铠甲武士/阴影与雷光的对决(大和敢助、上原由衣初登场)
608 危险的二人组
609-612 死亡之馆 赤壁(诸伏高明初登场)
705-706 毒与幻的设计
807-809 红衣女的惨剧
865-867 县警的黑暗