复旦大学的“复旦”二字的来源较为复杂，有两种说法：
一种说法是，复旦二字取自明代徐霞客的《徐霞客游记》中的一句话：“夫十年树木，百年树人。不教无术之人，防于为民之心。复旦之后，敦慎可鉴。”这句话意味着“教育是培养人才的根本，教育的目的是培养能够为人民服务的人才”，因此，复旦大学在命名时取了“复旦”二字，寓意“复兴中国、振兴中华”。
另一种说法是，复旦二字取自《尚书》中的“有旦”二字，意为“早上起来”，寓意“早上起来读书，为了充实自己，为了国家民族的复兴而奋斗”。这种说法也与复旦大学的育人宗旨相符合。
无论哪种说法，复旦二字都寓意着教育的重要性和为国家民族的复兴而奋斗的使命感。
重新拥戴马相伯创立了复旦公学，校名"复旦"便是于右任所取，表示不忘"震旦"之旧，更含复兴中华的意义。
复旦"二字出自《尚书大传》中的一篇《虞夏传》。《尚书大传》的作者是公元前二世纪的大学者伏生。
