当然有区别。杭州户口指主城区户口，包含上城区、西湖区、拱墅区、江干区、滨江区、萧山区、余杭区、临平区、钱塘区、富阳区和临安区共十一个区。杭州市户口指整个杭州市行政区域的户口。通常指的是除上述11区外的建德市、桐庐县、淳安县户口。这三个县市与杭州主城区都比较远，不通地铁，但有高铁。特别是建德、淳安，距离杭州100公里以外，基本都是山区。两种户口最主要的区别在医保社保、子女入学入托、购房资格等项。
杭州户籍是指杭州市大市范围所有户口种类的总称，包括农村户、集体户、城镇户和家庭户等。
杭州市区户籍是指杭州市市辖区的户口，也就是主城区的户口。
杭州市户口申请条件：
一、夫妻投靠 夫妻婚龄满3年，一方在杭有合法固定住所，人户一致的，由当事人向户口所在地派出所申请办理相关手续。
二、老年投靠
（1）男年满60周岁，女年满55周岁，子女全部或多数在杭州市区，外地身边无子女，在杭有合法固定住所的，可以申请投靠在杭子女；
（2）原籍为杭州市区的，男年满55周岁，女年满50周岁，有子女在杭，在杭有合法固定住所的，可申请投靠在杭子女。
三、未成年子女投靠父母 未满18周岁的未成年子女（户口在大中专院校的除外），可按自愿原则投靠在杭父母。
四、全日制普通高校本科及以上学历人才引进。
