在距今约8亿年的元古代，梵净山一带还是一片汪洋。后来，这片南方古陆被抬升隆起，成为中国黄河以南最早从海洋中抬升为陆地的古老地区。
随后经过长达数亿年的多次地质构造运动，终于崛起成为横亘于贵州、湖北、湖南、重庆一带的武陵山脉最高峰。
山顶的岩石为 8 亿年前海洋沉积的砂泥岩变质而成的板岩，山体中部夹多层海底火山喷发或岩浆侵入形成的火成岩。
险峻陡峭的峰峦和沟壑、高耸的石柱群与柱状峰，都是第四纪冰川和地表水等地质作用共同改造的杰作，构建出了特殊的梵净山地貌，并与林涛、云海共同构成了梵净山独特的景观。
